Do najczęstszych błędów należą: tworzenie zbyt długich list kompetencji, brak jasnych definicji poziomów zaawansowania, mieszanie kompetencji z obowiązkami oraz nieregularna aktualizacja danych. Problemem bywa również brak standaryzacji oceny kompetencji, co utrudnia porównywanie wyników i prowadzenie spójnej polityki rozwojowej.